我为最后生还者2写了一个新的故事
前面都与现作一致，艾莉和女友的小镇生活，谈情说爱，出门巡逻等等。
分歧点在乔尔和汤米被抓住的地方，这里乔尔并没有被打死，而是艾莉一行人及时赶到，两军交火，最后都跑了出来，回到了杰克逊小镇。但是杰克逊小镇人的行踪和社区位置已彻底暴露。。。
乔尔在和火萤干仗的时候也发现了艾比这帮人的来路，发现了是自己当年屠杀火萤留下的残党，而他们的目的便是针对乔尔的个人寻仇。
于是这个时候发生现作一开始的剧情，乔尔向汤米私下坦述了在火萤医院发生的事情，告诉汤米，他们的目标就是乔尔一个人。
为了艾莉的安危（害怕火萤为了抗体再次抓走艾莉），为了不连累杰克逊小镇，乔尔意识到，只有独自离开这里，再次主动出击，才可能换来其他人的安宁。于是一个人再次背上行囊，悄然离开，唯一知道的人只有汤米，并且他特别嘱咐汤米一定不能让艾莉知道真相，并且留下了遗嘱，内容就是大概：即使我不能够回来也无论如何不能让艾莉去复仇，把她自己再次陷入险境。
乔尔怀着无比承重的心情再次上路，他心里非常清楚他肩上的使命，要么杀了艾比，杀了所有剩下的火萤，要么用自己的死换来和平，无论如何他必须为自己一代最后的“自私”行为（为救艾莉屠杀火萤）买单。
乔尔对艾莉的爱是自私的也是最真实的，他当然不想就这样与艾莉绝别，于是他优先选择的前者—杀光火萤。
然后就是西雅图第一天，第二天，第三天（玩法层面就不多说了）。。。。反正乔尔一路杀戮，过五关斩六将。。。。然而最后火萤残党的势力远不及乔尔的想象，乔尔在复仇的路上被火萤活捉了，接下来就一场严刑加折磨，在没有杀死乔尔的前提下，能多残忍有多残忍（自己想象吧）
乔尔线就在这里转换，视角又回到了艾莉这边。艾莉因为很多天没有看到乔尔，感到惊讶，去找汤米要个说法，聪明的艾莉意识到了汤米言辞的反常，再三要挟之下，汤米还是把事情的所有真像告诉了艾莉，给她看了乔尔的留言，然而艾莉直接撕了遗嘱。
艾莉知道以后又气又恨，各种复杂的情绪涌上心头，气是在于乔尔这么多年来对她的欺骗，恨又在于乔尔这个老家伙竟然再一次为了她前去赴死。
艾莉意识到这个事情千丝万缕原来和她自己有关，她必须去解决这一切，救下乔尔，把一切都要个说法。于是她也背上行囊，不顾玛利亚，汤米等人的劝阻，毅然出发，当然也可以有同行的人，比如缇娜，杰西等人。
然后就是艾莉的西雅图之旅第四天，第五天这一段我认为不要太长的流程，艾莉两天后跟随乔尔的脚步很快杀到了关押乔尔的地方（并非艾比大本营）。此时的乔尔仅一息尚存，被钉在了十字架上，早已被折麽透了（参考现作艾比最后的场景），艾莉救下乔尔，乔尔躺在艾莉怀里，艾莉问道“看看我们都做了什么，我们都成什么样了？（两个人如杀人魔一般，为了彼此已经杀了太多太多），这一切真的值得吗？当年你为什么要救我！为什么剥夺我选择的权利！”
这个时候乔尔说出现作最后的那个经典台词，同时呼应一代“假如上天再给我一次机会，我还是会那么做。。。”
（艾莉和乔尔的这趟寻仇之旅让他们意识到了火萤残党远比他们想象中的规模要大的多，已经发展成了诸如wlf的组织。不过艾比只是个小头。不是组织老大。）
最后艾莉救出乔尔，在逃亡过程中，乔尔因为身负重伤，实在拖累艾莉无法前行，并且他知道只要他还活着杰克逊小镇的每一个人就不可能安宁，最终还是还是会有人来寻仇，毕竟艾比都还没死，所以最后乔尔还是牺牲了自己（愿意的话你们自行脑补一个壮烈牺牲的场面吧）乔尔临终前嘱咐艾莉一定不要为自己报仇，只希望她好好活着就好。自己已经完成了救赎，这是他的命运如此，不希望艾莉再为他做任何冒险的事情，否则一切牺牲都白费了。
但艾莉心中现在只有愤怒，仇恨，短暂调整以后，艾莉决定杀光剩下的所有人，于是又出发了。。。
西雅图第七天，第八天，第九天。。。艾莉杀到了艾比的老巢，该是最终的对峙了，毫无疑问你需要面对艾莉的选择，杀还是不杀？。。。这里我不想写一个固定的结局，大家每个人应该心里都有自己的答案。